Az NTDI képzési programja szerves folytatását jelenti a Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar akkreditált MSc szakjainak. Ezek a következők:

 

Agrármérnöki MSc (OH-FRKP/17.600-3/2007)

Növénytermesztő mérnöki MSc (OH-FHF/1329-10/2008)

Mezőgazdasági biotechnológus MSc (OH-FRKP/328-5/2007)

Növényorvosi MSc (OH-FRKP/17.601-3/2007)